یک دانش آموز انتقالی تلاش می کند تا خشن ترین دبیرستان کشور را تصاحب کند که دانش آموزان آن دسته بندی می کنند و برای قدرت با یکدیگر می جنگند.

در زمانه‌ای که هیولاها به زمین قدم گذاشته‌اند، مبارزه بشر برای آینده‌اش سبب رویارویی گودزیلا و کونگ شده و دو نیروی قدرتمند را در نبردی ویرانگر مقابل هم قرار داده. در حالی که سازمان سری مونارک مأموریتی پرخطر در مناطق ناشناخته آغاز و سرنخ‌هایی از تاتیتان‌ها کشف می‌کند، توطئه‌ای بشری همه‌ مخلوقات از قبیل خیر و شر را به محو شدن از روی زمین برای همیشه تهدید می‌کند..

داستان زمانی اتفاق می افتد که شینیچی هنوز دانش آموز دبیرستانی بود. کارآگاهی جوان با استعداد به نام کودو شینیچی پیامی دریافت می کند: "من یکی از همکلاسی هایت را در سفر کلاسی تو خواهم دزدید". لذا او در صدد کشف حقیقت پشت این پیام مرموز بر میاید.

داستان درباره یک دانش آموز دبیرستانی هست که به طور اتفاقی دفتر خاطرات یکی از همکلاسی هایش به نام ساکورا را پیدا میکند و متوجه میشود که او از بیماری پانکراس رنج می برد و…